The Caped Crusader se encuentra en las Batcuevas debajo de Gotham City. Robin ha sido capturado por los adversarios de Batman, principalmente el Joker y con la astuta ayuda de Riddler. La única esperanza de escapar es reunir al fiel Batcraft cuyas partes yacen esparcidas por las catacumbas mortales debajo y luego salir a toda velocidad para rescatar a Robin.
Una vez que se encuentren las 7 partes faltantes del Batcraft, Batman tendrá que buscar la plataforma de lanzamiento, después de lo cual podrá encender los motores y comenzar el rescate. Para ayudar a Batman en sus tareas más formidables, en sus viajes podrá adquirir poderes adicionales. Estos poderes no son eternos, pero le permitirán a Batman un impulso temporal de energía. No hace falta decir que Riddler ha confundido aún más las cosas al colocar imágenes que son indistinguibles y, si se recogen, negarán cualquier
energía adicional que Batman haya podido recolectar.
Batman puede aumentar sus vidas, correr más rápido, saltar más alto o estar completamente protegido de los secuaces del Joker. Si recolecta un artículo colocado por Riddler, perderá inmediatamente todos estos poderes adicionales y tendrá que buscar más para renovarlos.
El exitoso montaje del Batcraft es el objetivo del juego.