Después de derrotar al malvado Gran Visir Jaffar al final de su primera misión, nuestro héroe se prepara para una vida en paz con su amada Princesa. Pero, no todo está bien en la tierra de Persia y pronto se hace evidente que Jaffar ha regresado para vengarse de la feliz pareja. Asumiendo la identidad del héroe, Jaffar entra en el Castillo para robar a la Princesa, lanzando un hechizo a todo su alrededor mientras avanza. Cuando el príncipe regresa al castillo, se sorprende al ver a su doble. No solo eso, sino que los guardias del palacio lo atacan y lo obligan a escapar de la ciudad como polizón en un barco mercante. Así comienza el capítulo más importante de la vida del Príncipe de Persia. Una aventura que lo llevará a través de cinco entornos exóticos, una aventura que lo enfrentará a oponentes expertos en el juego de la espada o con capacidades mágicas. Entra en mazmorras místicas y evita fogatas, trampillas, pociones venenosas y placas de presión que disparan dardos letales. Sumérjase en la batalla de habilidad y valentía que es La Sombra y La Llama, y devuelva a nuestro Héroe a su legítima posición como Príncipe de Persia.