Juegas a Drak, el último de los Obliterators (máquinas mejoradas genéticamente diseñadas biológicamente para misiones que de otro modo serían imposibles). Tu misión es salvar a la Federación de una nave espacial alienígena.
Obliterator es un juego de acción de plataformas estilo arcade. Las pantallas del juego son estáticas (en lugar de desplazarse, aunque opcionalmente puedes activar las transiciones de desplazamiento entre pantallas) y pueden ser como un laberinto en ocasiones, con muchas ubicaciones para buscar. Armado con una variedad de armas, debes abordar la nave espacial alienígena, desactivar sus armas, unidades de plasma y escudos, y luego escapar.