Spider-Man: Battle for New York permite a los jugadores asumir el papel de Spider-Man y uno de sus famosos némesis, Green Goblin, en una historia original que se basa en su legendaria rivalidad de cómics. Por primera vez en un juego portátil de Spider-Man, los jugadores pueden personalizar sus experiencias de juego eligiendo qué habilidades y poderes actualizar y cuándo, como las maniobras web de Spider-Man o los ataques de fuego de Green Goblin, a medida que avanzan en el juego. Jugando como el bien y el mal, los jugadores experimentarán niveles llenos de acción frenética, combates en profundidad y una serie de súper movimientos únicos mientras se embarcan en la búsqueda definitiva para salvar a la ciudad de Nueva York de un desastre casi seguro.