Para atrapar al asesino en serie perfecto, se necesita a la persona que mejor conoce sus métodos… su última víctima. Tras haber sido asesinada en las calles de Mardock, a la joven prostituta Rune Balot se le ofrece la posibilidad de regresar a la vida mediante el protocolo de emergencia para preservar la vida conocido como Mardock Scramble 09. Ya convertida en cyborg, la única razón de ser de Balot es dar caza al hombre que la mató y entregarlo a la justicia. Para ello cuenta con la ayuda de una IA con forma de ratón capaz de transformarse en cualquier arma o herramienta. ¿Logrará el híbrido perfecto entre fantasma y máquina acabar con un monstruo capaz de borrar su propia memoria? El futuro se teñirá de rojo mientras la venganza golpea las calles.